在生物处理污水工艺中，需要用显微镜每天观察曝气池中的生物相。作为监控工艺运行的辅助方法。只是定性地判断活性污泥的状况。其优点是监控活性污泥方便、及时，随时可判断污泥状况，供调整运行工艺参考。
在活性污泥工艺运行中，由于进水水质以及环境因素变化等原因，造成生物相发生变化，会导致污泥出现质量问题。一般会有生物相异常，污泥上浮，污泥膨胀，生物泡沫等现象发生。运行人员要及时观察生物相，提出解决的对策。因此需运行控制人员熟练掌握活性污泥中最常见及普遍存在的微型指示生物及其变化规律，即一般生物相。据此对曝气池中运行异常的微生物相做出判断。以便及时采取措施，调整工艺运行。正常的活性污泥中，一般有变形虫、鞭毛虫、草履虫、钟虫、轮虫、线虫等几种微型指示生物。通过观察这些微生物的某一种或几种是否占优势以及比例的多少，来定性评判工艺运行状态。
